纪念建筑
北京祠
在东城区西裱褙胡同23号，原有门匾书“于忠肃公祠”。成化二年(1466)，宪宗皇帝特诏追认复官。将其故宅改为忠节祠。万历十八年(1590)时改谥“忠肃”，并在祠中立于谦塑像。清顺治年间，像毁，祠也废。清光绪年间又重建。祠坐北朝南，东为于谦故宅，院内东侧建有奎光楼，为两层小楼。上层为魁星阁，悬“热血千秋”木匾，正房5间为享堂，硬山合瓦顶，内供于谦塑像。1890年，义和团曾在此设神坛。1976年魁星阁在地震时被震毁，小楼亦被拆除。祠为北京市重点保护文物。
杭州祠
于谦墓位于浙江省杭州市风景秀丽的三台山麓，西湖乌龟潭畔。于谦祠位于于谦墓旁。
明朝弘治二年（1489），于谦冤案得以平反，孝宗皇帝表彰其为国效忠的功绩,赐谥“肃愍”，并在墓旁建祠纪念，取名 “旌功祠”。五百多年来，于谦祠屡毁屡建，现存建筑为 清同治 八年重建的旧迹，格局尚属完整，自91年5月起，先后经四次修缮，至1998年，值于谦诞辰600周年之际，于谦祠重新对外开放。
于谦祠为传统型的祠堂建筑，白墙灰瓦，朱漆大门，“于忠肃公祠”几个篆书大字显得庄严肃穆。祠堂共有三进，为前殿、正殿和后殿，前殿与正殿间，有南北厢房各一，厢房北面另有配殿一间，建筑面积约900多平方米。庭院里草木葱茏、绿树成荫，是一处清幽之所。
前殿辟为序厅，殿门两侧楹联是林则徐所撰：“公论久而后定，何处更得此人”。清朝嘉庆壬午年（1822）六月，林则徐任浙江杭嘉湖道，他倡议集资整修于谦祠墓，并带头捐献自己的官奉。上悬匾额“百世一人”，是对于谦一生功绩的高度概括。序厅正中一巨大石灰岩上镌刻着前言，石灰岩造型取意于谦青少年时所作作《石灰吟》，“粉身碎骨全不怕，要留清白在人间”也正是于谦一生刚正不阿、两袖清风高洁品性的真实写照。两侧墙上陈列于谦年表、于谦世系表，一张绘于清代的于谦夫妇像尤为引人注目。厅内还放置造型简洁的案几、椅等明式家具以渲染气氛。
正殿是于谦祠的主体部分，也是陈列最具特色的地方，通面宽21.8米，进深14.15米。大殿正中是一座于谦全身立像，于公威严肃立，双目炯炯，正气凛然。像高3.2米，基座1.3米，为海水浪花图案。像后衬以由徐向前元帅书写的《石灰吟》壁面，塑像上方悬挂乾隆御题匾额：“丹心抗节”，黑底金字，为乾隆十六年乾隆帝南巡杭州凭吊于谦时所题。殿柱上悬挂数幅颂扬于谦不朽功绩的楹联，均是明清时期的名家所撰，经当代书法家题写。大殿墙面为两幅半圆大型浮雕壁画，左侧是“北京保卫战”，右侧是“土木堡之变”的有关场景，每幅画相对独立，但在整体上又呵成一气，场面颇为凝重、壮观，运用明暗变幻的灯光效果，再辅以铿锵激越的《十面埋伏》背景音乐，使人产生身临其境之感，恍如置身于刀光剑影、杀声震天、尘土飞扬的古战场，正与于谦一起抵御外侮。壁画高3米，宽46米，是经专家多次论证修改，在中国美术学院雕塑家王卓予先生的指导下完成。壁画突破了一般祠堂陈列的窠臼，使壁面不见柱子，与匾额、楹联、塑像遥相呼应，具有强烈的艺术震撼效果。塑像背面的墙壁上嵌有清代石碑若干块，其中包括湘乡杨昌 题的线刻《明少保兵部尚书赠太傅谥忠肃于公像》碑一块，袁枚题《重修于忠肃庙碑》残碑九块。
后殿陈列于谦生平事迹，采用图版和照片相结合的形式，分“少年壮志”、“勤政廉明”、“保卫北京”、“永垂青史”四个部分，详细介绍了于谦高尚的品格、卓越的功绩以及悲壮的人生。两侧的陈列柜中，分别展示了于谦的著作和历代有关于谦的评述著作，有《于肃愍公集》、《于少保萃忠全传》、《于忠肃公祠墓录》等。
南北厢房分别作为兵器室和接待室。兵器室陈列明代的各种军械，包括神机营用的火铳、火炮等。明代的兵器门类多、数量大、制作精、技术高，有较高的研究和欣赏价值。
前殿与后殿间的天井里，赫然立着一尊威武、雄壮的铁犀牛，身高约2米，围长约2.5米，周身乌黑，独角朝天，背上铸有于谦亲撰的《镇河铁犀铭》，它是于谦勤政爱民、治理黄河的一个历史见证。黄河自古多泛滥，巡抚河南期间，他励精图治，奔波于大河上下，全心治理水患。为鼓舞人民战胜洪灾的信心，在1446年，派人铸了这尊“镇河铁犀”，表达了希望根除黄河水患，使百姓过上安定幸福生活的美好愿望。原物现存于河南开封铁牛村。
天井右侧有口井，井旁立碑，名之为“忠泉”。根据祠内清时李铎遗碑记载：康熙乙亥年，在改建于谦祠时发现此泉，泉水色清而味甘，因念“公之大忠诚如水之在地中”，故以此命名。后殿的院子里还保存着数明清两代的石碑，分别是四块大碑（弘治、嘉靖、万历、康熙）及一块乾隆年间的残碑。
于谦祠是杭州市第五批爱国主义教育基地，经过几年的规划与建设，已形成了包括于谦祠、于谦墓、墓道、牌坊等文物建筑与自然山林、绿地相结合的于谦祠景区，面积也由最初的6000平方米扩大到31000平方米。景区正在修建于谦雕塑广场、忠泉池、于谦诗碑廊，计划把配殿恢复为祈梦殿，随着西湖西进工程的进展，于谦祠景区将成为一处重要的人文景观。
杭州墓
于谦墓位于浙江省杭州市风景秀丽的三台山麓，西湖乌龟潭畔。明弘治二年（1489），明孝宗表彰其为国效忠的功绩，赐谥“肃愍”，并在墓旁建旌功祠，设春秋二祭，形成祠墓合一格局。
出于谦祠大门向北约50米，可见一明式牌坊，墓道长长，芳草萋萋，两旁肃立的石翁仲、石兽，为墓区平添几分肃穆与庄严。百米墓道的尽头，是省级重点文物保护单位于谦墓，墓碑上书“大明少保兼兵部尚书赠太傅谥忠肃于公墓”，是1982年修复墓时重新镌刻的，碑下的浮雕缠枝牡丹基座，和墓前的石供桌，均为明时原物。
1966年，于谦墓于1966年文革中区被毁。1982年，重建于谦墓，将原七座坟茔改为一座，墓高2米，青砖环砌，重刻墓碑，上书“大明少保兼兵部尚书赠太傅谥忠肃于公墓”，墓前设祭桌、香炉。1998年，为纪念于谦诞生600周年，在墓道两侧配置仿明式石翁仲、石兽及牌坊，整治墓区环境，修复于谦祠，建成于谦景区。在这次湖西综合保护工程中，于谦祠又经保护整修，恢复了于谦祠牌坊和甬道，现已成为湖西重要的人文景观。为浙江省省级文物保护单位。
原墓坐西朝东，呈马蹄形，有七座坟，墓侧建旌功祠，又名于谦祠，南北宽23米，进深30米，墓道长90米。后毁于1966年，今于谦墓为1982年重建。对于谦，清代袁枚曾赞颂道：“赖于岳于双少保，人间始觉重西湖”。
2006年05月25日，于谦墓作为明至清古墓葬，被国务院批准列入第六批全国重点文物保护单位名单。
诗碑廊
位于谦墓右侧，建于2002年，廊内陈列于谦自撰诗及后人缅怀诗碑刻十七块。
杭州故居
于谦故居位于杭州清河坊祠堂巷41号。于谦，杭州人，15岁考中秀才，16岁起就读于吴山三茅观，写下了有名的《石灰吟》，这诗成为他一生为人的写照。因于谦少上上吴山读书，至今吴山上尚有“于街”之称。明成化二年（1466），于谦案昭雪，故宅改建为怜忠祠，以资纪念，巷亦名祠堂巷。如今，故居的忠肃堂、思贤庭、古井已照原貌修缮一新，陈列于谦生平事迹，原有的旗杆石、造像碑等遗物，亦一并展出。于谦故居占地不大,进们便可看见影壁上刻者于谦的名诗《石灰吟》：千锤万凿出深山，烈火焚烧若等闲。粉骨碎身浑不怕，要留清白在人间。现为杭州市文物保护单位，杭州市爱国主义教育基地。于谦读书处
吴山三茅观景区位于吴山景区的南面，北与吴山城隍阁景区、吴山阮公祠景区接壤；西与浙江革命烈士纪念馆相连；东面景区大都锲入市区，与南宋皇城遗址、南宋太庙遗址相贴；南面与郁郁葱葱的五云山山林腹地景观相切。三茅观原名三茅堂，南宋绍兴二十年（1150），因东都旧名赐额“三茅宁寿观”。殿名太元，内奉徽宗御画茅君像。三茅真君是指秦汉时得到成仙的茅氏三兄弟：长盈、次固、季衷。宋时此观极为显赫，历朝赐是观的御书有：高宗《黄庭度人经》，宁宗“道纪堂”字，理宗《养生论》。绍兴年间（1131-1160），赐古器三种：一宋鼎，为宋孝武帝孝建元年作；又一为唐钟，本唐澄清观旧物，上有河东薛此铭；另一则是褚遂良小楷《阴符经》。近志则增以吴道子《南方星君像》、玉靶剑、七宝数珠、轩辕镜为观中七宝，一时连山都以七宝为名。时并于观后筑“七十二”瑶台，遍植桃花，春时郊祭，时有“瑶台万玉”之称 ，为当时“吴山八景”之一。元朝时三茅观毁于兵火，明初重建。时观内设有书馆，于谦曾在此读书，并写下了千古传唱的《石灰吟》。抗战时三茅观为日军拆毁，然而其规模甚大的遗迹仍依稀可辨 ，水池、小桥、巨石构建仍存。石壁间近十方摩崖石刻均已漫漶，仅存一方明万历时重刻的绍兴年间赐额宁寿观的尚书省牒文。
牒文为：牒奉敕宣赐宁寿观，牒到准敕，故牒。绍兴二十年。尚书省奉赦赐题临安府七宝山三茅堂，太师尚书仆射同中书门下平章（押），参知政事余（押）。签书枢院事参知政事巫（押），绍兴二十年天牒。
经考古发掘，三茅观遗址上保留较为完整的围墙墙址，园路（有部分香糕砖路）和建筑格局，通过挖掘整理后作为遗址保护向公众展示，将成为吴山景区三期工程中的重要景点。
《咏于谦》 （临安·万宽）
毓秀山河正气微，浮云久蔽遁天威。
龙颜欲触先生死，凤诏即承有是非。
清白才能持悬日，淡宁成性著宽衣。
一生难得春秋梦，万丈青松大国稀。
